48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2757 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  40.64 
 
 
254 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
250 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
252 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
256 aa  92.4  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  27.45 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  42.42 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  29.89 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0765  glycosyl transferase family 25  45.36 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  37.61 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  37.61 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  29.8 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  36.54 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  25.71 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  35.79 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  34.78 
 
 
253 aa  53.1  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  32.08 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1040  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 
1122 aa  52.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  31.96 
 
 
759 aa  52  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  30.93 
 
 
703 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  36.11 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
318 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  21.54 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3318  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
272 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
255 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  38.24 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 
250 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  21.72 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6471  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
218 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160461  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  27.65 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0824  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>