42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0457 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  65.88 
 
 
260 aa  351  7e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0791  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  35.02 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  28.44 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  35.11 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  24.7 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
250 aa  55.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  22.9 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
229 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
272 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  27.59 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4050  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  42.19 
 
 
759 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  30.11 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  29.51 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0765  glycosyl transferase family 25  31.87 
 
 
267 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
254 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4166  glycosyl transferase family 25  26.53 
 
 
271 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  40.62 
 
 
703 aa  45.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4193  glycosyl transferase family 25  25.51 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  28.57 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0824  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  31.18 
 
 
294 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  32.22 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
239 aa  42  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
239 aa  42  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>