42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3698 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 272 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  50.56 
 
 		 275 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  52.92 
 
 		 241 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  33.04 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  28.14 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.04 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  32.12 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  25 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  33.33 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  23.65 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  23.32 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  29.7 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  34.55 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001816  LPS biosynthesis glycosyltransferase  26.84 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00205752  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  27.52 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  35 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0745  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0144834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3318  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  25.11 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  30.08 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0791  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  26.42 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4229  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.220008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4050  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  25.11 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>