26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0116 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0824  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  26.69 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  25.75 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  25.29 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  23.08 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  23.08 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  26.85 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  22.7 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0637  lipooligosaccharide biosynthesis protein  42.03 
 
 		 158 aa  47  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3773  glycosyl transferase family 25  23.19 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>