48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00665 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  100 
 
 
241 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  35.44 
 
 
297 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  29.57 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.38 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  30.96 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3773  glycosyl transferase family 25  25.39 
 
 
268 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  22.17 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  27.36 
 
 
252 aa  62  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  33.88 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  29.35 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  22.77 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  22.77 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  25.41 
 
 
703 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  34.41 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  25.82 
 
 
759 aa  56.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  23.56 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0745  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0144834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001816  LPS biosynthesis glycosyltransferase  22.88 
 
 
253 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00205752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  22.02 
 
 
249 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  22.32 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  22.49 
 
 
260 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  31.93 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
260 aa  48.5  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  32.35 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  23.46 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0637  lipooligosaccharide biosynthesis protein  34.88 
 
 
158 aa  47  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
260 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0791  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  26.78 
 
 
265 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  21.72 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  32.22 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4166  glycosyl transferase family 25  27.97 
 
 
271 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  22.16 
 
 
318 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>