56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3927 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  55.47 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  50.6 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  50.66 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  34.04 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  29.55 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  28.74 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  26.79 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  33.04 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  27.72 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  24.7 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  31.43 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0765  glycosyl transferase family 25  28.71 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  24.31 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  32.41 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  30 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  26.32 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  32.47 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  26.7 
 
 		 759 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  26.7 
 
 		 703 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  29.36 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  30.53 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  25.23 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  22.7 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  34.65 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.89 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  26.34 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3773  glycosyl transferase family 25  23.53 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0791  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  23.64 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4050  glycosyl transferase family protein  20.18 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0824  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4166  glycosyl transferase family 25  23.45 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44770  hypothetical protein  24.89 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001816  LPS biosynthesis glycosyltransferase  25.74 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00205752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4193  glycosyl transferase family 25  23.45 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>