31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3129 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  100 
 
 		 275 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 		 318 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.22 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  24.59 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  26.61 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  30.97 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  28.68 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  24.74 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  23.46 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  34.62 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  21.35 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  34.17 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  42 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>