21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1186 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 829 aa  1704    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.18 
 
 		 773 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  22.93 
 
 		 1070 aa  64.7  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  22.94 
 
 		 1090 aa  63.9  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  25.07 
 
 		 1065 aa  62  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0120  O-antigen polymerase  25.09 
 
 		 1065 aa  61.6  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.66 
 
 		 428 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  43.48 
 
 		 467 aa  51.2  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  31.5 
 
 		 472 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  21.55 
 
 		 874 aa  50.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0658  O-antigen polymerase family protein  23.77 
 
 		 398 aa  48.1  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.238334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  24.22 
 
 		 845 aa  47.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1276 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2167  immunoreactive 53 kDa antigen PG123  27.07 
 
 		 479 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  25.95 
 
 		 456 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 430 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  24.69 
 
 		 615 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  27.34 
 
 		 467 aa  44.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  24.54 
 
 		 929 aa  44.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  20.48 
 
 		 495 aa  44.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  34.07 
 
 		 426 aa  44.3  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>