More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4007 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 419 aa  793    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  82.55 
 
 		 416 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  76.05 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  75.43 
 
 		 411 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  77.84 
 
 		 411 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  67.4 
 
 		 414 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  71.58 
 
 		 382 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  64.29 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  59.9 
 
 		 407 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  57.71 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  59.59 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  55.11 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  58.5 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  53.47 
 
 		 409 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  53.95 
 
 		 411 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  54.71 
 
 		 405 aa  359  5e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  58.54 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  50.5 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  56.35 
 
 		 403 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  56.49 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 394 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  50.13 
 
 		 394 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  54.86 
 
 		 409 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  48.83 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  55.01 
 
 		 420 aa  335  7e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  47.52 
 
 		 414 aa  335  7e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  50.78 
 
 		 395 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  50.51 
 
 		 411 aa  322  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  49.35 
 
 		 403 aa  322  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  53.47 
 
 		 412 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  50.14 
 
 		 423 aa  312  7.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  48.86 
 
 		 422 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  47.67 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  51.06 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  56.32 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  55.65 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 392 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  48.87 
 
 		 393 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  49.03 
 
 		 400 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  43.71 
 
 		 367 aa  269  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 391 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  45.2 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  45.9 
 
 		 392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  45.2 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  45.2 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  45.2 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  45.2 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 391 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 		 399 aa  265  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  45.2 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 389 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 		 405 aa  262  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  46.45 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 392 aa  259  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  44.7 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  45.9 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  46.47 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 		 408 aa  253  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 407 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  45.11 
 
 		 388 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  44.09 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  39.78 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  45.75 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  47.51 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  43.87 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  44.16 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  43.59 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>