20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5389 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5389  O-antigen polymerase (wzy)  100 
 
 
405 aa  783    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.933006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1208  O-antigen polymerase  26.36 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  26.15 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13033  O-antigen polymerase (wzy)  26.9 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  24.79 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  24.86 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0149  O-antigen polymerase  26.34 
 
 
388 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0144  O-antigen polymerase  26.34 
 
 
388 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  26.49 
 
 
773 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  25.98 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  24.79 
 
 
426 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  23.97 
 
 
426 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  23.97 
 
 
426 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  25 
 
 
440 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  28.37 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  22.19 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  27.13 
 
 
737 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  24.1 
 
 
461 aa  43.9  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0583  O-antigen polymerase  27.43 
 
 
449 aa  43.9  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  26.45 
 
 
438 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>