44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1208 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1208  O-antigen polymerase  100 
 
 		 426 aa  850    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5389  O-antigen polymerase (wzy)  25.37 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.933006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  28.77 
 
 		 773 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  25 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.44 
 
 		 512 aa  50.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  27.22 
 
 		 686 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 686 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  27.27 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  22.77 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  37.1 
 
 		 594 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  25.65 
 
 		 578 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  25.9 
 
 		 537 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  24.2 
 
 		 569 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  31.46 
 
 		 393 aa  46.6  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13033  O-antigen polymerase (wzy)  35.37 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  27.97 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  33.9 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  31.82 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  32.22 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  19.01 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  24.23 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  25.79 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  23.31 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  25.71 
 
 		 594 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  23.15 
 
 		 607 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  29.13 
 
 		 595 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  29.51 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  29.13 
 
 		 661 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  20.66 
 
 		 456 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  29.13 
 
 		 595 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  32.05 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  29.13 
 
 		 595 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  29.13 
 
 		 595 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  29.13 
 
 		 595 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  29.13 
 
 		 595 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  21.89 
 
 		 592 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  21.89 
 
 		 592 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  33.6 
 
 		 500 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  21.89 
 
 		 592 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  32.43 
 
 		 595 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0602  lipid A core--O-antigen ligase  24.51 
 
 		 416 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  33.87 
 
 		 593 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  24.37 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>