31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5297 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5297  O-antigen polymerase  100 
 
 		 670 aa  1289    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  40.31 
 
 		 647 aa  83.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1952  O-antigen polymerase  37.09 
 
 		 653 aa  76.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.953343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  32.17 
 
 		 535 aa  73.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  22.94 
 
 		 735 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  37.65 
 
 		 1070 aa  56.2  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  29.38 
 
 		 455 aa  50.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  32.08 
 
 		 717 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  32.41 
 
 		 454 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  32.48 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  23.57 
 
 		 845 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  22.79 
 
 		 509 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.33 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1208  O-antigen polymerase  32.41 
 
 		 426 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  20.7 
 
 		 612 aa  48.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5512  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 		 722 aa  48.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  28.12 
 
 		 470 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  26.61 
 
 		 393 aa  47.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  31.78 
 
 		 425 aa  47.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 594 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  25.56 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  28.48 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 446 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  30.48 
 
 		 595 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  27.62 
 
 		 594 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0271  O-antigen polymerase  28.79 
 
 		 760 aa  44.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  30.99 
 
 		 456 aa  45.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 1090 aa  43.9  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  29.52 
 
 		 661 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  21.54 
 
 		 773 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>