9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2022 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2022  O-antigen polymerase  100 
 
 		 340 aa  682    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2741  O-antigen polymerase  58.97 
 
 		 333 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.448774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  28.77 
 
 		 415 aa  132  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0161  O-antigen polymerase  28.66 
 
 		 440 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  30 
 
 		 717 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  26.03 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  25.25 
 
 		 426 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  21.4 
 
 		 424 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>