23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0979 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0979  O-antigen polymerase  100 
 
 
523 aa  999    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4498  O-antigen polymerase  30.12 
 
 
447 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  30.33 
 
 
671 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  24.73 
 
 
393 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  29.87 
 
 
668 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  25.18 
 
 
461 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  30.57 
 
 
459 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  26.62 
 
 
440 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  21.76 
 
 
579 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  27.03 
 
 
672 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  26.72 
 
 
597 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  36.04 
 
 
647 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  29.09 
 
 
498 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  27.4 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1241  hypothetical protein  23.2 
 
 
396 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  27.66 
 
 
467 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.67 
 
 
501 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  31.41 
 
 
410 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  27.91 
 
 
397 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  26 
 
 
456 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3885  O-antigen polymerase  26.99 
 
 
443 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.722344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>