12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0480 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0480  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  907    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  38.36 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  38.06 
 
 		 459 aa  226  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  25.78 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  29.13 
 
 		 418 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  29.13 
 
 		 418 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0442  O-antigen polymerase  21.39 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  29.76 
 
 		 540 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  38.03 
 
 		 717 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  22.7 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3375  O-antigen polymerase  24.6 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221665  normal  0.11504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  21.99 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>