7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1928 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1928  O-antigen polymerase  100 
 
 
415 aa  806    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0538104  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  27.42 
 
 
781 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  28.57 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  31 
 
 
502 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  27.04 
 
 
540 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  24.68 
 
 
492 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0143  O-antigen polymerase  22.6 
 
 
405 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>