78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2120 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2120  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 505 aa  970    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2118  TPR repeat-containing protein  36.1 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 934 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  27.58 
 
 		 931 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 923 aa  73.6  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0951  tetratricopeptide TPR_2  34.44 
 
 		 613 aa  72.4  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 886 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  40 
 
 		 929 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  26.7 
 
 		 864 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 900 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 884 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 927 aa  64.3  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 860 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 883 aa  63.9  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.36 
 
 		 571 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 944 aa  63.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.08 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.09 
 
 		 883 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 880 aa  60.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  28.03 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  28.03 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 		 955 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 952 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2046  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 479 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 		 579 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.93 
 
 		 935 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2297  TPR domain-containing protein  36.23 
 
 		 226 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 800 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  26.69 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  26.69 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 		 1073 aa  53.9  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  26.78 
 
 		 420 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0178  hypothetical protein  25.79 
 
 		 880 aa  53.9  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441956  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 420 aa  53.9  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  26.78 
 
 		 420 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 420 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  26.78 
 
 		 420 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0754  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 453 aa  53.5  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  35.04 
 
 		 882 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  35.04 
 
 		 882 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  33.04 
 
 		 931 aa  50.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 366 aa  50.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  41.46 
 
 		 767 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 567 aa  50.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 767 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 886 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  32.17 
 
 		 924 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.35 
 
 		 267 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 620 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 612 aa  47.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  31 
 
 		 584 aa  47.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 		 892 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1858  serine/threonine protein kinase  27.96 
 
 		 922 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000651604 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.88 
 
 		 557 aa  47.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  26.95 
 
 		 924 aa  47.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  28.24 
 
 		 729 aa  47.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  28.38 
 
 		 231 aa  47  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 917 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 642 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 602 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 4079 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.6 
 
 		 577 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  30.33 
 
 		 270 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.59 
 
 		 186 aa  44.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3615  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 353 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242924  normal  0.313882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 638 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1069 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 607 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.63 
 
 		 612 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  20.83 
 
 		 1297 aa  43.9  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.17 
 
 		 1737 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 878 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 511 aa  43.5  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 		 572 aa  43.5  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 464 aa  43.5  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>