60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2118 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2118  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 504 aa  960    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2120  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 505 aa  190  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 923 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 878 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.77 
 
 		 1067 aa  60.5  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 927 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.95 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 944 aa  57  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1676 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0951  tetratricopeptide TPR_2  30.86 
 
 		 613 aa  55.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  28.42 
 
 		 1186 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 363 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 363 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.9 
 
 		 1737 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.33 
 
 		 397 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 1486 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.26 
 
 		 745 aa  53.5  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.42 
 
 		 1979 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  30.93 
 
 		 1172 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 543 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.15 
 
 		 564 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  30.73 
 
 		 1172 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 270 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 270 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 2240 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0813  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.038465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.15 
 
 		 1694 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 366 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 968 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.06 
 
 		 623 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.62 
 
 		 935 aa  47.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 767 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 662 aa  47.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  30.25 
 
 		 545 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20 
 
 		 557 aa  47  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  28.7 
 
 		 503 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  32.75 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 402 aa  47  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 465 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 		 352 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 3560 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  27.41 
 
 		 612 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  25.88 
 
 		 594 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0115  Tetratricopeptide domain protein  27.22 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1454  hypothetical protein  31.91 
 
 		 240 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 767 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.07 
 
 		 629 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.53 
 
 		 864 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.2 
 
 		 632 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.59 
 
 		 612 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 892 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 292 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 269 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.63 
 
 		 267 aa  44.3  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 503 aa  43.9  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 		 265 aa  43.5  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 4079 aa  43.5  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>