60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0951 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0951  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 613 aa  1146    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2046  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 479 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 923 aa  99.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 931 aa  91.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 952 aa  84  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2120  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1297 aa  71.6  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 934 aa  71.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.35 
 
 		 929 aa  67.4  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 4079 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 927 aa  57.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  29.55 
 
 		 939 aa  56.6  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2118  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 		 504 aa  57  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 2262 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 329 aa  55.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 565 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 655 aa  54.3  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 2240 aa  53.9  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 366 aa  53.5  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  21.88 
 
 		 924 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1276 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 883 aa  50.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 597 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3395  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 		 652 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105857  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 808 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.25 
 
 		 935 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  24.63 
 
 		 924 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.15 
 
 		 924 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  31.71 
 
 		 977 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3255  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 354 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360912 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 523 aa  47.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1049 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 886 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 711 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  21.26 
 
 		 462 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1138 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.59 
 
 		 1979 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  32.34 
 
 		 1098 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 202 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 377 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 2262 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 361 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25 
 
 		 573 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 576 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 		 265 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.22 
 
 		 1007 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 628 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 279 aa  44.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1922  tetratricopeptide TPR_2  32.98 
 
 		 142 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  24.82 
 
 		 581 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1112 aa  44.3  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  19.82 
 
 		 670 aa  44.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 273 aa  44.3  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 562 aa  44.3  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  29.6 
 
 		 444 aa  43.9  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1121 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 265 aa  43.5  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>