256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1918 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  77.98 
 
 		 495 aa  773    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 		 494 aa  1004    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  51.27 
 
 		 607 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  51.9 
 
 		 607 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  51.9 
 
 		 607 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  51.9 
 
 		 607 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  51.9 
 
 		 607 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  51.9 
 
 		 607 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 607 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 606 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  50 
 
 		 606 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 606 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  50 
 
 		 606 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  50 
 
 		 606 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  50 
 
 		 606 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  50 
 
 		 606 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  49.37 
 
 		 606 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  49.37 
 
 		 613 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  49.67 
 
 		 613 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  49.67 
 
 		 613 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  48.33 
 
 		 620 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  40 
 
 		 562 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  54.42 
 
 		 609 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  44.62 
 
 		 592 aa  159  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  50.96 
 
 		 625 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  49.37 
 
 		 594 aa  156  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  47.06 
 
 		 616 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.34 
 
 		 571 aa  154  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  44.28 
 
 		 599 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  45.88 
 
 		 587 aa  153  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  46.28 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  45.4 
 
 		 572 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  43.5 
 
 		 584 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  47.77 
 
 		 573 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 581 aa  142  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  47.77 
 
 		 573 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  47.33 
 
 		 595 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  41.72 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  42.27 
 
 		 584 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  46.5 
 
 		 573 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  45.68 
 
 		 575 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  45.06 
 
 		 575 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  43.2 
 
 		 595 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  44.44 
 
 		 574 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  45.06 
 
 		 590 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  45.06 
 
 		 556 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  41.57 
 
 		 616 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  48.67 
 
 		 575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  38.03 
 
 		 635 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  46.5 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  45.22 
 
 		 573 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  36.28 
 
 		 586 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.21 
 
 		 574 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  35.98 
 
 		 591 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  40.74 
 
 		 645 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.95 
 
 		 645 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  44.44 
 
 		 642 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  38.46 
 
 		 603 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.4 
 
 		 564 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 		 553 aa  117  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  38.65 
 
 		 603 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  38.92 
 
 		 619 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.33 
 
 		 574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  37.19 
 
 		 585 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.52 
 
 		 610 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  39.38 
 
 		 573 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  35.48 
 
 		 551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  34.89 
 
 		 619 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 595 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 572 aa  110  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  38 
 
 		 559 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 559 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 610 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 566 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  34.91 
 
 		 425 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  32.98 
 
 		 572 aa  107  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  35.37 
 
 		 677 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  35.58 
 
 		 621 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  35.58 
 
 		 621 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  39.85 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 		 607 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 621 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  33.53 
 
 		 566 aa  100  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  34.73 
 
 		 579 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 642 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.67 
 
 		 582 aa  96.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 599 aa  95.9  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  37.12 
 
 		 584 aa  95.9  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.76 
 
 		 633 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 617 aa  94  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  35.07 
 
 		 583 aa  94  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.1 
 
 		 633 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 		 631 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  34.48 
 
 		 593 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 638 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 562 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.63 
 
 		 572 aa  90.5  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>