31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20135 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  48.13 
 
 		 673 aa  638    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  100 
 
 		 690 aa  1415    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  46.26 
 
 		 696 aa  608  9.999999999999999e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  44.57 
 
 		 726 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53682  predicted protein  33.24 
 
 		 714 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00710  pre-mRNA splicing factor prp1, putative  23.16 
 
 		 946 aa  78.6  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.547118  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00111  Pre-mRNA-splicing factor syf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH69]  20.73 
 
 		 851 aa  70.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07447  mRNA splicing factor (Prp1/Zer1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06070)  23.09 
 
 		 941 aa  70.5  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.143301  normal  0.632834 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38035  predicted protein  26.91 
 
 		 1869 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01310  spliceosome complex protein, putative  26.11 
 
 		 1031 aa  65.5  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87186  TPR-repeat containing protein  24.61 
 
 		 544 aa  64.7  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  29.58 
 
 		 977 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42299  predicted protein  23.36 
 
 		 873 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43635  predicted protein  21.06 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01200  rRNA processing-related protein, putative  28.02 
 
 		 1484 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 465 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02147  rRNA biogenesis protein RRP5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16040)  20.41 
 
 		 1780 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0471871  normal  0.489753 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  20.61 
 
 		 765 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13053  predicted protein  20.39 
 
 		 725 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.34373  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42368  predicted protein  23.97 
 
 		 563 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0945405  normal  0.143131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 866 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  22.91 
 
 		 341 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45871  predicted protein  30.86 
 
 		 944 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39705  Pre-mRNA splicing factor prp1  21.14 
 
 		 901 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  23.15 
 
 		 1098 aa  45.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28863  predicted protein  29.13 
 
 		 897 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421294  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45989  predicted protein  22.01 
 
 		 1008 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400632  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25551  predicted protein  23.31 
 
 		 692 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0800445  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  22.38 
 
 		 258 aa  44.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04892  mRNA 3'-end-processing protein rna14 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B3I8]  27.93 
 
 		 1075 aa  44.3  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549976 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 1297 aa  43.9  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>