12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53682 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_53682  predicted protein  100 
 
 		 714 aa  1450    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  39.63 
 
 		 673 aa  497  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  37.73 
 
 		 696 aa  459  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  35.96 
 
 		 726 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  33.24 
 
 		 690 aa  390  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00111  Pre-mRNA-splicing factor syf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH69]  21.07 
 
 		 851 aa  64.7  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45989  predicted protein  31.97 
 
 		 1008 aa  58.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400632  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42368  predicted protein  23.11 
 
 		 563 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0945405  normal  0.143131 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07447  mRNA splicing factor (Prp1/Zer1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06070)  23.97 
 
 		 941 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.143301  normal  0.632834 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00710  pre-mRNA splicing factor prp1, putative  21.88 
 
 		 946 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.547118  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  24.81 
 
 		 765 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  25 
 
 		 977 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>