22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00710 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA00710  pre-mRNA splicing factor prp1, putative  100 
 
 		 946 aa  1922    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.547118  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07447  mRNA splicing factor (Prp1/Zer1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06070)  46.58 
 
 		 941 aa  838    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.143301  normal  0.632834 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45989  predicted protein  38.75 
 
 		 1008 aa  625  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400632  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43635  predicted protein  41.25 
 
 		 847 aa  598  1e-169  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39705  Pre-mRNA splicing factor prp1  29.15 
 
 		 901 aa  412  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  23.16 
 
 		 690 aa  77.8  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25551  predicted protein  21.33 
 
 		 692 aa  63.9  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0800445  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  20.38 
 
 		 673 aa  62.4  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  24.85 
 
 		 765 aa  58.9  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01200  rRNA processing-related protein, putative  26.09 
 
 		 1484 aa  53.5  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42368  predicted protein  21.38 
 
 		 563 aa  50.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0945405  normal  0.143131 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  20.82 
 
 		 696 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53682  predicted protein  21.88 
 
 		 714 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 690 aa  47.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 808 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  30.68 
 
 		 726 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.66 
 
 		 1067 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 581 aa  46.2  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87186  TPR-repeat containing protein  24.62 
 
 		 544 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  26.09 
 
 		 1230 aa  45.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  23.56 
 
 		 690 aa  45.1  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 465 aa  44.3  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>