79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2555 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2555  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
728 aa  1482    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1029  peptidase aspartic, active site  31.58 
 
 
654 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 
827 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.91 
 
 
795 aa  62  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1193  hypothetical protein  28.23 
 
 
654 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4327  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  41.76 
 
 
253 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813272  hitchhiker  0.000000000191123 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.36 
 
 
354 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
639 aa  55.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
612 aa  54.7  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
605 aa  54.3  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
635 aa  54.3  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
635 aa  54.3  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
2262 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
636 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
637 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
611 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.8 
 
 
626 aa  52.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.32 
 
 
620 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 
828 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
620 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
761 aa  51.6  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
614 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.14 
 
 
626 aa  51.2  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.14 
 
 
626 aa  51.2  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
614 aa  51.2  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.14 
 
 
614 aa  50.8  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
614 aa  50.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.14 
 
 
614 aa  50.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.7 
 
 
352 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
886 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
638 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.38 
 
 
732 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0881  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.18 
 
 
253 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904873  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.71 
 
 
725 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
828 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2585  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
424 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
592 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
301 aa  49.3  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4603  Type IV pilus biogenesis protein PilF  30.33 
 
 
252 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.31 
 
 
632 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.76 
 
 
883 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
615 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
544 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
1406 aa  48.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.85 
 
 
413 aa  48.1  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  24.26 
 
 
586 aa  47.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.62 
 
 
436 aa  47.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
593 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2021  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
222 aa  47.4  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0625937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
2262 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
927 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
878 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  30.53 
 
 
564 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0047  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
788 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.210348  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.16 
 
 
634 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
935 aa  45.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.52 
 
 
654 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
602 aa  45.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
601 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
762 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  32.46 
 
 
587 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
203 aa  45.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.31 
 
 
1138 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.91 
 
 
545 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.28 
 
 
708 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 
530 aa  44.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
572 aa  44.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.22 
 
 
810 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1753  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
366 aa  44.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
505 aa  44.3  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
653 aa  44.3  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0666  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
293 aa  44.3  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.107374  normal  0.0631773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
520 aa  44.3  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
587 aa  44.3  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  23.78 
 
 
2679 aa  44.3  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  26.85 
 
 
417 aa  43.9  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  28.26 
 
 
1247 aa  43.9  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 
836 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.86 
 
 
574 aa  43.9  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>