25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1029 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1193  hypothetical protein  92.35 
 
 		 654 aa  1208    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1029  peptidase aspartic, active site  100 
 
 		 654 aa  1323    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3173  tetratricopeptide TPR_4  38.74 
 
 		 937 aa  294  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1748  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 1157 aa  241  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00388  putative signal peptide protein  35.24 
 
 		 585 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.052584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2660  hypothetical protein  29.9 
 
 		 564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4694  conserved hypothetical signal peptide protein  34.63 
 
 		 574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0218305  normal  0.0355925 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3617  putative signal peptide protein  34.63 
 
 		 574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2942  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 955 aa  143  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297804  normal  0.363556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0568  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 940 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0632734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2555  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 728 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 		 562 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 886 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2725  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 856 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 789 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 2262 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  29.84 
 
 		 451 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 		 643 aa  47.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3450  hypothetical protein  23.28 
 
 		 879 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 371 aa  45.8  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2933  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  23.92 
 
 		 1000 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863782  normal  0.205822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2487  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  23.37 
 
 		 1001 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.2 
 
 		 1677 aa  44.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 		 602 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1866  von Willebrand factor, type A  30.39 
 
 		 628 aa  44.3  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>