18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2725 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2725  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 856 aa  1710    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 927 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1748  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 1157 aa  53.9  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  20.36 
 
 		 448 aa  51.6  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  22.14 
 
 		 519 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 4489 aa  50.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1193  hypothetical protein  35.25 
 
 		 654 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1029  peptidase aspartic, active site  36.67 
 
 		 654 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 433 aa  48.1  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 423 aa  47.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 750 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 4079 aa  45.8  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 802 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  24.22 
 
 		 1172 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.46 
 
 		 1694 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.75 
 
 		 1979 aa  45.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 556 aa  44.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 		 632 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>