18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2487 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3450  hypothetical protein  93.4 
 
 		 879 aa  1630    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2933  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  86.21 
 
 		 1000 aa  1706    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863782  normal  0.205822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2487  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  100 
 
 		 1001 aa  2013    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1711  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  58.02 
 
 		 1049 aa  1108    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.261559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3449  hypothetical protein  93.1 
 
 		 143 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.992287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3084  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  25.58 
 
 		 990 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0581  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  25.58 
 
 		 990 aa  109  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0585  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  25.27 
 
 		 990 aa  108  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3061  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 990 aa  105  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0641  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  25.27 
 
 		 990 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.369188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2660  hypothetical protein  28.25 
 
 		 564 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3173  tetratricopeptide TPR_4  28.99 
 
 		 937 aa  55.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1748  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 1157 aa  55.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00388  putative signal peptide protein  25.5 
 
 		 585 aa  48.5  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.052584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4694  conserved hypothetical signal peptide protein  24.46 
 
 		 574 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0218305  normal  0.0355925 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3617  putative signal peptide protein  24.46 
 
 		 574 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1029  peptidase aspartic, active site  23.67 
 
 		 654 aa  45.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0568  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 940 aa  45.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0632734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>