39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3061 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0581  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  99.09 
 
 		 990 aa  2009    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0641  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  99.09 
 
 		 990 aa  2008    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.369188 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3061  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 990 aa  2026    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0585  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  98.89 
 
 		 990 aa  2001    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3084  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  98.89 
 
 		 990 aa  2005    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1711  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  24.79 
 
 		 1049 aa  112  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.261559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2487  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  25.27 
 
 		 1001 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3450  hypothetical protein  25.8 
 
 		 879 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2933  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  25.74 
 
 		 1000 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863782  normal  0.205822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3173  tetratricopeptide TPR_4  37.7 
 
 		 937 aa  72.8  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  35.71 
 
 		 575 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  35.19 
 
 		 591 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  34.41 
 
 		 573 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 573 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 575 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 573 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 573 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1748  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1157 aa  53.9  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  32.26 
 
 		 575 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  31.18 
 
 		 590 aa  52  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  29.63 
 
 		 520 aa  52  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  31.18 
 
 		 574 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 464 aa  51.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4694  conserved hypothetical signal peptide protein  23.83 
 
 		 574 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0218305  normal  0.0355925 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3617  putative signal peptide protein  23.83 
 
 		 574 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 		 564 aa  49.7  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 		 778 aa  48.5  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.68 
 
 		 582 aa  48.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81748  mitochondrial outer membrane specialized import receptor  25.69 
 
 		 585 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  31.41 
 
 		 619 aa  46.6  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 		 548 aa  47  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 3145 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  41.54 
 
 		 668 aa  45.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.37 
 
 		 370 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  45.76 
 
 		 1332 aa  45.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 229 aa  44.7  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 579 aa  44.7  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00388  putative signal peptide protein  22.66 
 
 		 585 aa  44.3  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.052584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>