25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2275 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  100 
 
 		 1332 aa  2618    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  77.23 
 
 		 1343 aa  1988    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  42.38 
 
 		 1327 aa  927    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 1306 aa  883    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  45.01 
 
 		 1368 aa  1060    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  41.25 
 
 		 1332 aa  923    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 1296 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 1279 aa  355  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 1345 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  25.83 
 
 		 944 aa  213  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 		 1249 aa  153  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  28.37 
 
 		 942 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0537  hypothetical protein  23.29 
 
 		 942 aa  104  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00112952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1190 aa  100  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1193 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3206  putative signal peptide protein  33.22 
 
 		 299 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1963  putative signal peptide protein  29.19 
 
 		 299 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.789583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1193 aa  75.5  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  26.8 
 
 		 755 aa  64.3  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0536  hypothetical protein  22.4 
 
 		 387 aa  50.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.120824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3084  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  38.71 
 
 		 990 aa  46.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0581  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  38.3 
 
 		 990 aa  46.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0585  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  45.76 
 
 		 990 aa  45.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0641  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  45.76 
 
 		 990 aa  45.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.369188 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3061  TPR repeat-containing protein  45.76 
 
 		 990 aa  45.1  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>