12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1711 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3450  hypothetical protein  57.34 
 
 		 879 aa  1003    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1711  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  100 
 
 		 1049 aa  2056    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.261559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2487  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  58.21 
 
 		 1001 aa  1132    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2933  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  58.81 
 
 		 1000 aa  1139    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863782  normal  0.205822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3449  hypothetical protein  60.95 
 
 		 143 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.992287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0581  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  24.93 
 
 		 990 aa  125  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3084  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  24.79 
 
 		 990 aa  125  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0585  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  24.5 
 
 		 990 aa  121  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3061  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 990 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0641  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  24.93 
 
 		 990 aa  119  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.369188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2660  hypothetical protein  25.27 
 
 		 564 aa  46.2  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  35.85 
 
 		 690 aa  46.2  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>