15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2660 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2660  hypothetical protein  100 
 
 		 564 aa  1149    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_003296  RS00388  putative signal peptide protein  50.09 
 
 		 585 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.052584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4694  conserved hypothetical signal peptide protein  52.55 
 
 		 574 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0218305  normal  0.0355925 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3617  putative signal peptide protein  52.55 
 
 		 574 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1748  TPR repeat-containing protein  37.64 
 
 		 1157 aa  320  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1029  peptidase aspartic, active site  29.9 
 
 		 654 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3173  tetratricopeptide TPR_4  37.16 
 
 		 937 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1193  hypothetical protein  34.22 
 
 		 654 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0568  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 940 aa  96.3  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0632734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2942  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 955 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297804  normal  0.363556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3450  hypothetical protein  28.25 
 
 		 879 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2487  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  28.25 
 
 		 1001 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2933  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  24.3 
 
 		 1000 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863782  normal  0.205822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1711  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  29.09 
 
 		 1049 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.261559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 781 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>