27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2942 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2942  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 955 aa  1914    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297804  normal  0.363556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0568  TPR repeat-containing protein  43.49 
 
 		 940 aa  617  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0632734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1193  hypothetical protein  26.31 
 
 		 654 aa  151  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1029  peptidase aspartic, active site  26.26 
 
 		 654 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1748  TPR repeat-containing protein  34.28 
 
 		 1157 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3173  tetratricopeptide TPR_4  26.76 
 
 		 937 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2660  hypothetical protein  24.48 
 
 		 564 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_003296  RS00388  putative signal peptide protein  24.69 
 
 		 585 aa  100  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.052584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3617  putative signal peptide protein  23.95 
 
 		 574 aa  97.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4694  conserved hypothetical signal peptide protein  23.95 
 
 		 574 aa  97.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0218305  normal  0.0355925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 927 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 4079 aa  56.2  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 1198 aa  54.7  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4608  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 1404 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.406661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 634 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3499  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 254 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.14 
 
 		 471 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 187 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 		 174 aa  47  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 428 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 1276 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  30.41 
 
 		 1237 aa  45.8  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.5 
 
 		 746 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.6 
 
 		 458 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.15 
 
 		 308 aa  44.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8140  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 275 aa  44.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 306 aa  44.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>