15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0568 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0568  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 940 aa  1870    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0632734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2942  TPR repeat-containing protein  43.97 
 
 		 955 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297804  normal  0.363556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1193  hypothetical protein  27.32 
 
 		 654 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1029  peptidase aspartic, active site  26.62 
 
 		 654 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1748  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 1157 aa  132  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3173  tetratricopeptide TPR_4  27.17 
 
 		 937 aa  120  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4694  conserved hypothetical signal peptide protein  26.27 
 
 		 574 aa  104  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0218305  normal  0.0355925 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3617  putative signal peptide protein  26.27 
 
 		 574 aa  104  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2660  hypothetical protein  23.93 
 
 		 564 aa  97.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_003296  RS00388  putative signal peptide protein  24.24 
 
 		 585 aa  88.6  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.052584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.43 
 
 		 883 aa  48.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2933  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  35.82 
 
 		 1000 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863782  normal  0.205822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2487  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  34.33 
 
 		 1001 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3450  hypothetical protein  34.33 
 
 		 879 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.01 
 
 		 511 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>