103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2021 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2021  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 222 aa  443  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0625937 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.89 
 
 		 1979 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 827 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.65 
 
 		 818 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 927 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.23 
 
 		 878 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.99 
 
 		 587 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  37.78 
 
 		 576 aa  52  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6695  hypothetical protein  28.8 
 
 		 360 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1138 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  31.31 
 
 		 1213 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 		 1056 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 		 354 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.26 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.89 
 
 		 988 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 393 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.57 
 
 		 512 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.08 
 
 		 836 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  33.7 
 
 		 545 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.66 
 
 		 1056 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.06 
 
 		 784 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 		 409 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 423 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 395 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.66 
 
 		 610 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.39 
 
 		 1022 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 944 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 		 1737 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1069 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 2262 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 505 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 565 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.66 
 
 		 610 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.86 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.71 
 
 		 462 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3375  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 306 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110631  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 929 aa  45.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1121 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 1049 aa  45.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 		 990 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 760 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.63 
 
 		 706 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 645 aa  45.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0755  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 730 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548835  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 414 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  31.43 
 
 		 676 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  25.31 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  26.73 
 
 		 545 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 540 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  36.23 
 
 		 652 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 616 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 467 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 615 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 665 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 543 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1085 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 935 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  26.27 
 
 		 379 aa  43.9  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 		 373 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 647 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.29 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  32.22 
 
 		 452 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2555  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 728 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 486 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 3560 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 402 aa  43.5  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1450 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.97 
 
 		 730 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  25.52 
 
 		 417 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  29.81 
 
 		 1014 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 		 1486 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 1252 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 302 aa  42.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 265 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.61 
 
 		 725 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2768  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 250 aa  42.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 4079 aa  42.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0986  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 479 aa  42.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 616 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0341  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 752 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0002  tetratricopeptide TPR_2  29.27 
 
 		 128 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00992655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  26.44 
 
 		 614 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 273 aa  42  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0602  RNA polymerase alpha subunit domain protein  34.57 
 
 		 451 aa  42  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125598  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 287 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 713 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.71 
 
 		 681 aa  42  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  26.57 
 
 		 643 aa  41.6  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  27.4 
 
 		 475 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  25.24 
 
 		 417 aa  41.6  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>