40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2102 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2102  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 728 aa  1464    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.892588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0188  tetratricopeptide TPR_2  50.08 
 
 		 651 aa  556  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0175  hypothetical protein  51.97 
 
 		 554 aa  536  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0292228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 585 aa  104  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  23.19 
 
 		 590 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  24 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 581 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  24.07 
 
 		 586 aa  82  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  23.76 
 
 		 574 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  24.23 
 
 		 520 aa  80.5  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 575 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  23.42 
 
 		 575 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  24.52 
 
 		 584 aa  78.2  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 573 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  23.5 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 573 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 573 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  24.64 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  22.82 
 
 		 603 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.82 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.21 
 
 		 571 aa  57.4  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 		 599 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.33 
 
 		 582 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 592 aa  52  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 		 581 aa  52  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  26.4 
 
 		 609 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.7 
 
 		 574 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 562 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 616 aa  48.5  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  24.66 
 
 		 551 aa  48.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2585  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 424 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508719  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  21.33 
 
 		 635 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 613 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 613 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 		 564 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  24.22 
 
 		 613 aa  46.6  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  20.9 
 
 		 616 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 		 584 aa  45.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 557 aa  44.3  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>