25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0175 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0175  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1104    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0292228 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0188  tetratricopeptide TPR_2  93.32 
 
 		 651 aa  1040    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2102  tetratricopeptide TPR_4  51.97 
 
 		 728 aa  528  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.892588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 585 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  24.88 
 
 		 584 aa  80.1  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  23.1 
 
 		 575 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  24.64 
 
 		 573 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  23.17 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  22.93 
 
 		 590 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  23.83 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  22.08 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.42 
 
 		 574 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  21.46 
 
 		 574 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.61 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.61 
 
 		 603 aa  58.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 573 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.32 
 
 		 582 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.91 
 
 		 581 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 606 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  21.84 
 
 		 573 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>