118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1375 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1375  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  554  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.668942  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.8 
 
 		 622 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.84 
 
 		 764 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.14 
 
 		 810 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 566 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 878 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.08 
 
 		 725 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 718 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  26.72 
 
 		 475 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32 
 
 		 935 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 1737 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 3145 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 934 aa  52.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 542 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25 
 
 		 887 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 2262 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 505 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 708 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 748 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.6 
 
 		 561 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.94 
 
 		 358 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  26.06 
 
 		 456 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.77 
 
 		 632 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 3035 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.12 
 
 		 762 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 3172 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 402 aa  48.9  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.12 
 
 		 762 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  37.38 
 
 		 1837 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 711 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  21.17 
 
 		 661 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.6 
 
 		 561 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 833 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 828 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.39 
 
 		 639 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  28.5 
 
 		 937 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 637 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 3560 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  34.44 
 
 		 603 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.48 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  23.29 
 
 		 875 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  28.26 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.45 
 
 		 363 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 602 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.44 
 
 		 553 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.45 
 
 		 363 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.14 
 
 		 2240 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.13 
 
 		 865 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 714 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 399 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  27.72 
 
 		 601 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 578 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1714 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  23.14 
 
 		 725 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.23 
 
 		 626 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.23 
 
 		 626 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  28.97 
 
 		 487 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.22 
 
 		 730 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 597 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 955 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.71 
 
 		 512 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 466 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 681 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  26.51 
 
 		 542 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  32.37 
 
 		 562 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  27.53 
 
 		 1237 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  24.82 
 
 		 1014 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.16 
 
 		 1694 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 828 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1676 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.07 
 
 		 587 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  23.96 
 
 		 545 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  32.26 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 574 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 697 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 226 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.25 
 
 		 614 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  31.73 
 
 		 609 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.25 
 
 		 614 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 614 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 		 565 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.77 
 
 		 795 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 931 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 577 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.89 
 
 		 979 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 750 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 614 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.24 
 
 		 882 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 584 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 		 354 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 3301 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>