112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3527 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3527  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
235 aa  458  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  43.98 
 
 
842 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3726  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 
339 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000157755  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 
330 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1321  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000464925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 
503 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2216  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 
170 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1549  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000551888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.34 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.4 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.8 
 
 
782 aa  65.1  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2657  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 
168 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0340  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 
298 aa  62  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 
599 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  27.44 
 
 
305 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0342  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
298 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
976 aa  58.9  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
804 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 
1507 aa  55.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.11 
 
 
725 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  27.7 
 
 
1044 aa  55.1  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
1038 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
534 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.15 
 
 
261 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  32.09 
 
 
992 aa  52.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 
1288 aa  52.4  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  27.32 
 
 
464 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0344  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 
298 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  35.81 
 
 
985 aa  52  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.08 
 
 
392 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
3145 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  25.56 
 
 
1402 aa  52  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  27.38 
 
 
693 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.67 
 
 
316 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.35 
 
 
1131 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
1101 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  26.7 
 
 
393 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  35.14 
 
 
1180 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  35.14 
 
 
1172 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  35.14 
 
 
1180 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1217  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.17 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
751 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.54 
 
 
1493 aa  49.7  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  35.14 
 
 
1150 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  35.14 
 
 
1150 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0523  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
631 aa  48.9  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0179552  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
568 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 
568 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.63 
 
 
684 aa  48.5  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
409 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.49 
 
 
2145 aa  48.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0733  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.27 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  23.94 
 
 
489 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  24.18 
 
 
321 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 
409 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  24.76 
 
 
425 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.7 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
409 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
405 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
1313 aa  45.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 
716 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  26.61 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  26.11 
 
 
331 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  24.63 
 
 
672 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
374 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
1261 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  26.02 
 
 
831 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 
1063 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  33.82 
 
 
1160 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 
685 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
399 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
315 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.75 
 
 
884 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002652  Flp pilus assembly protein TadD  24.74 
 
 
337 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  25.93 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  26.83 
 
 
303 aa  43.5  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 
320 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
454 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
632 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.16 
 
 
1037 aa  43.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  35.14 
 
 
1157 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  35.14 
 
 
1157 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.25 
 
 
1475 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  35.14 
 
 
1140 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  35.14 
 
 
1157 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  35.14 
 
 
1157 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  35.14 
 
 
1157 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  35.14 
 
 
1157 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4770  Sel1 domain protein repeat-containing protein  20.11 
 
 
383 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
718 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 
565 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>