More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3963 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3963  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.187703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  52.28 
 
 
257 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.44 
 
 
257 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.31 
 
 
254 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
3145 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  30.77 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 
718 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.5 
 
 
810 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
878 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.54 
 
 
745 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.57 
 
 
632 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
750 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
629 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
909 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.03 
 
 
626 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.33 
 
 
816 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.02 
 
 
875 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.41 
 
 
1022 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
847 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.9 
 
 
1764 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.21 
 
 
1056 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 
649 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.6 
 
 
620 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
361 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
620 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  30.77 
 
 
321 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.09 
 
 
626 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
362 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.09 
 
 
626 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
315 aa  62.4  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
614 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
301 aa  62.4  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
522 aa  62.4  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.09 
 
 
614 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.09 
 
 
614 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
614 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.67 
 
 
631 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
612 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 
754 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 
1056 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.12 
 
 
614 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
754 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2888  type IV pilus biogenesis protein PilF, putative  34.17 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
637 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
685 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
615 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
366 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 
762 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
681 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1250  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.58 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.901782  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 
988 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 
833 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 
828 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 
2240 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 
646 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.36 
 
 
629 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
1121 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
764 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
594 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.92 
 
 
795 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
301 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.2 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.2 
 
 
340 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
767 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
649 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
649 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
1106 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
639 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
828 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
589 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 
1450 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
739 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
927 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
795 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
595 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
637 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.75 
 
 
714 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
636 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
670 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.74 
 
 
818 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 
363 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
635 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  32.31 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
611 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 
624 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
635 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
1737 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
402 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.82 
 
 
708 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
612 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
619 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 
363 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
700 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
601 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>