174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002652 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002652  Flp pilus assembly protein TadD  100 
 
 		 337 aa  689    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  33.44 
 
 		 344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  29.17 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.19 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2366  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.062914  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 3145 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.63 
 
 		 875 aa  59.7  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 878 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 718 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.13 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 762 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  24.58 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.1 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.46 
 
 		 503 aa  56.2  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 629 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 808 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.2 
 
 		 733 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25 
 
 		 1764 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.2 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.64 
 
 		 782 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.57 
 
 		 2145 aa  54.3  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 1252 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 934 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.68 
 
 		 632 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 1252 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.68 
 
 		 863 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.19 
 
 		 725 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.97 
 
 		 2401 aa  52.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2888  type IV pilus biogenesis protein PilF, putative  28.48 
 
 		 255 aa  52.8  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.82 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 		 689 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 1371 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 		 667 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.23 
 
 		 639 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 792 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 597 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 548 aa  50.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 		 632 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  22.09 
 
 		 620 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1676 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 409 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 643 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.23 
 
 		 758 aa  50.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 581 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.17 
 
 		 878 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.55 
 
 		 850 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 409 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.53 
 
 		 883 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1550 aa  49.3  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 847 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23.11 
 
 		 979 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 3172 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.14 
 
 		 739 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  33.61 
 
 		 991 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 638 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 1121 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 615 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 592 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 		 3301 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 		 620 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  27.13 
 
 		 936 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.98 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  25.53 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 		 833 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 839 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 649 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.64 
 
 		 622 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 161 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1309  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  32.35 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 534 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.459695 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.88 
 
 		 416 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.38 
 
 		 2240 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 589 aa  46.2  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 804 aa  46.6  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 968 aa  46.6  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.64 
 
 		 764 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.76 
 
 		 708 aa  46.6  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.29 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.08 
 
 		 566 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03050  ubiquitin-protein ligase, putative  24.52 
 
 		 773 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.56 
 
 		 739 aa  46.2  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 567 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 686 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 568 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>