39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3122 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3122  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 773 aa  1516    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 636 aa  84  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  32.79 
 
 		 1143 aa  70.1  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  26.79 
 
 		 549 aa  65.9  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  29.66 
 
 		 1139 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.08 
 
 		 1055 aa  62  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 644 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  38.41 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.37 
 
 		 1029 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4194  SARP family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 629 aa  58.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 644 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.71 
 
 		 1034 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  27.67 
 
 		 1101 aa  54.7  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 1217 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.34 
 
 		 1126 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  27.94 
 
 		 1056 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  26.03 
 
 		 494 aa  52.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.7 
 
 		 1013 aa  52  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  32.38 
 
 		 1083 aa  51.2  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  27.4 
 
 		 1097 aa  51.2  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  30.48 
 
 		 1204 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.27 
 
 		 1067 aa  50.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  24.4 
 
 		 641 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  26.15 
 
 		 521 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7646  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 529 aa  50.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.158995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 1050 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1578  SARP family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 530 aa  48.9  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.584481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3925  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 528 aa  47.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  29.26 
 
 		 650 aa  47.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5023  transcriptional regulator, SARP family  40.71 
 
 		 623 aa  47.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494336  normal  0.650955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 416 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.33 
 
 		 713 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0870  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 679 aa  45.8  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.918273 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1552  SARP family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 289 aa  44.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  0.0981278 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  34.29 
 
 		 1108 aa  44.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.16 
 
 		 1075 aa  44.3  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  24.09 
 
 		 518 aa  43.9  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>