15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4194 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4194  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 629 aa  1265    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  31.22 
 
 		 1055 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  22.83 
 
 		 641 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 647 aa  57  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  23.56 
 
 		 1111 aa  56.2  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  22.74 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.92 
 
 		 1029 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  24.66 
 
 		 375 aa  51.2  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3122  SARP family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 773 aa  50.8  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.44 
 
 		 999 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 1190 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  28.51 
 
 		 1013 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  26.76 
 
 		 1163 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  25.63 
 
 		 1022 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>