89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1158 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 277 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  48.03 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  41.85 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  38.94 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  39.22 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  39.56 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  40.76 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  32.08 
 
 		 1034 aa  79  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.22 
 
 		 1075 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  30.87 
 
 		 1163 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 1050 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.14 
 
 		 713 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 1064 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.17 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  27.03 
 
 		 650 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  26.34 
 
 		 1082 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  30.8 
 
 		 1092 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.69 
 
 		 1067 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  26.42 
 
 		 1071 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  36.46 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  29.63 
 
 		 621 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 1089 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  30.29 
 
 		 1139 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  28.92 
 
 		 641 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  31.13 
 
 		 1044 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.79 
 
 		 1029 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  32.77 
 
 		 965 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 636 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 1190 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  38.54 
 
 		 1114 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  24.65 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  27.89 
 
 		 992 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.4 
 
 		 1148 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.63 
 
 		 1339 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  27.1 
 
 		 1103 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  30.81 
 
 		 963 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  30 
 
 		 1083 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  30.07 
 
 		 931 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5071  SARP family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  29.95 
 
 		 981 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 1193 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  29.65 
 
 		 985 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  34.95 
 
 		 561 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  25.6 
 
 		 1204 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  24.61 
 
 		 867 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 655 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  30.25 
 
 		 1018 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  26.1 
 
 		 1145 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.21 
 
 		 1055 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.26 
 
 		 957 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  35.96 
 
 		 910 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  26.86 
 
 		 1163 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  32.04 
 
 		 1097 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  29.3 
 
 		 1000 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  26.56 
 
 		 1003 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  26.37 
 
 		 1013 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  26.34 
 
 		 1102 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  24.5 
 
 		 1017 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.53 
 
 		 999 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  37.01 
 
 		 1108 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  28.3 
 
 		 943 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  34.74 
 
 		 572 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  31.91 
 
 		 1008 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  34.19 
 
 		 926 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  26.87 
 
 		 1097 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  25.45 
 
 		 1126 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  27.91 
 
 		 990 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  24.7 
 
 		 952 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  30.83 
 
 		 1090 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  28.77 
 
 		 668 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  29.77 
 
 		 1123 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  26.55 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.62 
 
 		 1030 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 		 1005 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 1141 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 910 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 622 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  24.18 
 
 		 376 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  36.29 
 
 		 1183 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  29.68 
 
 		 934 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  37.39 
 
 		 885 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 1116 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  29.56 
 
 		 964 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 1100 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 1216 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  31.94 
 
 		 1138 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  30.25 
 
 		 1034 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 654 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>