223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5071 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5071  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  34.68 
 
 		 981 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  35.08 
 
 		 1027 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.29 
 
 		 453 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  34.32 
 
 		 1108 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  38 
 
 		 1004 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  35.92 
 
 		 1011 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.48 
 
 		 621 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 1014 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.04 
 
 		 990 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.22 
 
 		 1003 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.75 
 
 		 1022 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.45 
 
 		 992 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 654 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  35.94 
 
 		 954 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.05 
 
 		 995 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  34.63 
 
 		 1733 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5827  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  35.18 
 
 		 370 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.25 
 
 		 1033 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  31.87 
 
 		 1010 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.86 
 
 		 1022 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  36.72 
 
 		 1001 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  35.78 
 
 		 1020 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.24 
 
 		 1339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  30.92 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.68 
 
 		 919 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  30.94 
 
 		 1030 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  32.18 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 		 946 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 621 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.24 
 
 		 983 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.3 
 
 		 996 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.19 
 
 		 1093 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 965 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.48 
 
 		 921 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.66 
 
 		 631 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  30.6 
 
 		 950 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.94 
 
 		 957 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 1025 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.02 
 
 		 981 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 602 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 968 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.63 
 
 		 1092 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  30.37 
 
 		 597 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  32.1 
 
 		 1058 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1000 aa  99  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 1148 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  34.71 
 
 		 676 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 		 1017 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.24 
 
 		 934 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 378 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.39 
 
 		 931 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 622 aa  96.3  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  30.24 
 
 		 379 aa  96.3  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.45 
 
 		 1123 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  32.38 
 
 		 1121 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 921 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  35.59 
 
 		 910 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.64 
 
 		 1088 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  32.02 
 
 		 1097 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 489 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 		 611 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  32.17 
 
 		 926 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  33.02 
 
 		 1110 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  34.09 
 
 		 1003 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  32.53 
 
 		 1036 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  31.91 
 
 		 940 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  34.58 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  32.38 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 1021 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  30.8 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3688  transcriptional regulator, SARP family  30.96 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.38 
 
 		 935 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  31.28 
 
 		 1114 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  31.54 
 
 		 833 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  30.22 
 
 		 1090 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  32.53 
 
 		 1100 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 928 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  31.36 
 
 		 1699 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  30.2 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  29.62 
 
 		 993 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2444  SARP family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  30.89 
 
 		 655 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  31.75 
 
 		 1158 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  30.65 
 
 		 960 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 760 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  30.31 
 
 		 990 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  31.67 
 
 		 668 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  31.6 
 
 		 1118 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  30.98 
 
 		 1071 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 		 989 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  29.48 
 
 		 1186 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 1141 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>