65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1963 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  45.53 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  41.23 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  38.94 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  39.91 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  42.54 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  40.6 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  30.4 
 
 		 1034 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.09 
 
 		 1067 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  32.14 
 
 		 1029 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.41 
 
 		 1111 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  27.27 
 
 		 1097 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.6 
 
 		 1075 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  28.12 
 
 		 494 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.14 
 
 		 1055 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  29.44 
 
 		 1163 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  28.63 
 
 		 597 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 1050 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.41 
 
 		 1013 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 1089 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  29.76 
 
 		 1204 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  28.34 
 
 		 1022 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.27 
 
 		 1126 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 1190 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  30 
 
 		 1018 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 952 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  23.79 
 
 		 376 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  28.07 
 
 		 549 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 1064 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.96 
 
 		 496 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  30.25 
 
 		 965 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 1216 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  30.22 
 
 		 937 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  30.3 
 
 		 1005 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.21 
 
 		 713 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  28.97 
 
 		 1145 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 449 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  46.97 
 
 		 1058 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 621 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  26.38 
 
 		 1056 aa  45.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 1116 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  39.02 
 
 		 931 aa  45.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  48.48 
 
 		 1055 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  29.96 
 
 		 921 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  23.02 
 
 		 365 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 636 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 1048 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  26.53 
 
 		 992 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  32.86 
 
 		 910 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  26.92 
 
 		 689 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 1217 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  47.62 
 
 		 950 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  34.74 
 
 		 1087 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  35.14 
 
 		 561 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 423 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  27.89 
 
 		 1044 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  31.53 
 
 		 1018 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  26.96 
 
 		 1139 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.07 
 
 		 572 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  28.39 
 
 		 514 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  25.1 
 
 		 991 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 981 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  22.36 
 
 		 1082 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  33.67 
 
 		 926 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>