149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0284 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 689 aa  1382    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  28.61 
 
 		 1071 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  29.66 
 
 		 1082 aa  241  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  28.24 
 
 		 1055 aa  236  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.56 
 
 		 1061 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  26.48 
 
 		 1000 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  29.62 
 
 		 1031 aa  186  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  31.95 
 
 		 1190 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.27 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  29.2 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  28.16 
 
 		 1097 aa  79  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  27.69 
 
 		 1204 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 1100 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  30.04 
 
 		 1163 aa  74.3  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  28.14 
 
 		 934 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  27.69 
 
 		 1145 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  32.9 
 
 		 915 aa  72.4  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  24.68 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 1116 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  33.67 
 
 		 1097 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 1193 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.63 
 
 		 1056 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  32.28 
 
 		 1118 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  25.58 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  32.28 
 
 		 1118 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0410  response regulator receiver and SARP domain protein  24.11 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  31.62 
 
 		 661 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.45 
 
 		 572 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  32.19 
 
 		 1186 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  29.17 
 
 		 1733 aa  64.3  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  25.18 
 
 		 1083 aa  64.3  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  32.63 
 
 		 1029 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  31.78 
 
 		 926 aa  63.9  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.22 
 
 		 921 aa  63.9  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  29.49 
 
 		 1093 aa  63.9  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  29.74 
 
 		 1005 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 1216 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 968 aa  61.6  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  28.19 
 
 		 1108 aa  61.2  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  29.2 
 
 		 1018 aa  60.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  30.04 
 
 		 1042 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  29.86 
 
 		 981 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24290  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.9 
 
 		 392 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 636 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.59 
 
 		 1055 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4304  response regulator receiver and SARP domain protein  25.23 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  27.05 
 
 		 271 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  26.84 
 
 		 1075 aa  58.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  24.82 
 
 		 1094 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  31.7 
 
 		 1013 aa  58.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 1217 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  28.8 
 
 		 1110 aa  57.4  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  32.08 
 
 		 655 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.8 
 
 		 919 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  30.63 
 
 		 1058 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.75 
 
 		 631 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.95 
 
 		 1067 aa  56.6  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  28.95 
 
 		 981 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.49 
 
 		 1121 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  26.38 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  27.68 
 
 		 943 aa  55.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  31.63 
 
 		 1072 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  28.45 
 
 		 1014 aa  55.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  30 
 
 		 952 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  26.98 
 
 		 1109 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.29 
 
 		 713 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  31.58 
 
 		 1048 aa  54.7  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  27.07 
 
 		 990 aa  54.3  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  29.96 
 
 		 921 aa  54.3  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  31 
 
 		 1005 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  28.82 
 
 		 964 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  29.09 
 
 		 1064 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  24.46 
 
 		 1095 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  24.56 
 
 		 242 aa  52.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  29.21 
 
 		 940 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  29.53 
 
 		 954 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  26.92 
 
 		 967 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.58 
 
 		 1111 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  27.27 
 
 		 1102 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  26.64 
 
 		 931 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  29.83 
 
 		 300 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.99 
 
 		 496 aa  52.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  32.64 
 
 		 1055 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  28.02 
 
 		 983 aa  52  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 271 aa  51.6  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  31.61 
 
 		 910 aa  51.6  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29.73 
 
 		 1022 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  37.5 
 
 		 1056 aa  50.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  28.96 
 
 		 999 aa  50.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  30.57 
 
 		 1028 aa  50.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  30.85 
 
 		 1018 aa  50.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 210 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 1048 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  27.75 
 
 		 992 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>