77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2694 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  100 
 
 
435 aa  888    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  42.04 
 
 
242 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24290  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  22.19 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
1055 aa  80.1  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  24.81 
 
 
999 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  28.89 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  23.6 
 
 
1097 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  24.68 
 
 
689 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  21.51 
 
 
1190 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  20.75 
 
 
561 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  21.79 
 
 
1193 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  26.69 
 
 
661 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  20.43 
 
 
572 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  26.32 
 
 
1083 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  24.91 
 
 
1043 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  20.75 
 
 
1109 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  23.55 
 
 
1071 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  28.39 
 
 
1082 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  26.92 
 
 
1000 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  23.81 
 
 
1095 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  23.89 
 
 
378 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  24.26 
 
 
1094 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  19.59 
 
 
1116 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  22.64 
 
 
1204 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.18 
 
 
1111 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  30.97 
 
 
1061 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  24.47 
 
 
1158 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0410  response regulator receiver and SARP domain protein  22.69 
 
 
376 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  27.44 
 
 
1145 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  23.11 
 
 
940 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  24.11 
 
 
1072 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  20.53 
 
 
1055 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  24.24 
 
 
968 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  21.8 
 
 
1119 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  22.01 
 
 
1108 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  27.27 
 
 
1058 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  21.59 
 
 
775 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  27 
 
 
1042 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  21.77 
 
 
1093 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  22.73 
 
 
1092 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  19.18 
 
 
1118 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  19.18 
 
 
1118 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  23.94 
 
 
365 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0443  diguanylate cyclase  28.57 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2527  diguanylate cyclase  27.91 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  21.4 
 
 
921 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  24.29 
 
 
1100 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  23.95 
 
 
1000 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  26.45 
 
 
268 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  17.97 
 
 
300 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  28.14 
 
 
215 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  27.43 
 
 
372 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  21.11 
 
 
1020 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  22.94 
 
 
962 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  23.04 
 
 
428 aa  46.6  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  27.15 
 
 
621 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  23.53 
 
 
1108 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0266  diguanylate cyclase  31.75 
 
 
942 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.955306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  22.11 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  25.3 
 
 
210 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  23.38 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1537  diguanylate cyclase  27.18 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.88 
 
 
675 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  23.24 
 
 
1102 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  27.91 
 
 
981 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  21.43 
 
 
1071 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  25 
 
 
597 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  26.72 
 
 
493 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  21.11 
 
 
934 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  23.26 
 
 
523 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  22.31 
 
 
993 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  20.3 
 
 
266 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1137  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00579887  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  22.11 
 
 
342 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  22.52 
 
 
1018 aa  43.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  24.48 
 
 
261 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  19.81 
 
 
297 aa  43.1  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.149221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>