48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1697 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  87.97 
 
 		 349 aa  647    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 349 aa  716    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  29 
 
 		 343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.61 
 
 		 572 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.71 
 
 		 561 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.47 
 
 		 1111 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  28.4 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  25.21 
 
 		 1108 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  25.76 
 
 		 689 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  25.66 
 
 		 999 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  24.05 
 
 		 1083 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  22.92 
 
 		 1163 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  22.75 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  23.53 
 
 		 1095 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  24.79 
 
 		 1094 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.95 
 
 		 1055 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1812  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.32 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 636 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  22.03 
 
 		 1064 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.49 
 
 		 1029 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  25.74 
 
 		 1013 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  24.69 
 
 		 1034 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  21.52 
 
 		 1204 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  25.13 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  24.05 
 
 		 1145 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  24.44 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1055 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  19.58 
 
 		 1097 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  24.38 
 
 		 549 aa  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3491  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  23.15 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  21.67 
 
 		 1018 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  19.37 
 
 		 661 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09000  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  22.75 
 
 		 831 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 647 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  20.83 
 
 		 1055 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  23.74 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  19.46 
 
 		 1109 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  22.5 
 
 		 1193 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  20.68 
 
 		 867 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  22.22 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  20.38 
 
 		 775 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  19.91 
 
 		 981 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  21.84 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  21.52 
 
 		 1190 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  18.5 
 
 		 1116 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>