37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3491 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3491  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  100 
 
 		 360 aa  737    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2121  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  64.67 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2883  response regulator receiver and SARP domain protein  41.61 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000114352  decreased coverage  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  26.6 
 
 		 1204 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.91 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.51 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  27.76 
 
 		 1145 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  25.54 
 
 		 1097 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  28.48 
 
 		 1094 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  27.2 
 
 		 965 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  23.98 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  27.57 
 
 		 668 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  24.33 
 
 		 1163 aa  52.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  25.81 
 
 		 1083 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  24.34 
 
 		 1108 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  26.32 
 
 		 1095 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 1193 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  23.93 
 
 		 954 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  31.91 
 
 		 990 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  25.32 
 
 		 1022 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  26.29 
 
 		 1070 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  26.78 
 
 		 1054 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 1217 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  28.83 
 
 		 689 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.5 
 
 		 1339 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  25.74 
 
 		 631 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1775  Nucleotidyl transferase  24.23 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0199542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  20.85 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24290  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  25 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  24.06 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  21.29 
 
 		 376 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  22.93 
 
 		 1064 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  24.31 
 
 		 1068 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  26.25 
 
 		 981 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>