46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09000 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09000  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  100 
 
 		 831 aa  1711    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178339 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  42.69 
 
 		 867 aa  218  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.41 
 
 		 907 aa  140  7.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  29.02 
 
 		 1108 aa  75.5  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  25.9 
 
 		 365 aa  73.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 1190 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1291  transcriptional regulator, SARP family  24.41 
 
 		 1011 aa  71.2  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.475725 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.34 
 
 		 1193 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  22.82 
 
 		 1204 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  26.36 
 
 		 661 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  25.57 
 
 		 1083 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  23.53 
 
 		 1163 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  26.52 
 
 		 1018 aa  58.9  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  22 
 
 		 999 aa  58.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 349 aa  57.4  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  25.69 
 
 		 1055 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  21.9 
 
 		 1082 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  22.53 
 
 		 597 aa  55.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  24.91 
 
 		 261 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  25.29 
 
 		 267 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  24.41 
 
 		 449 aa  53.5  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  22.53 
 
 		 1093 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  24.03 
 
 		 1095 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 1319 aa  50.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  23.97 
 
 		 535 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 349 aa  50.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 968 aa  50.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  25.66 
 
 		 494 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  26.3 
 
 		 965 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 775 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1552  SARP family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 289 aa  49.3  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  0.0981278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  24.42 
 
 		 1094 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  21.45 
 
 		 561 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  22.05 
 
 		 1145 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3859  transcriptional regulator, SARP family  26.98 
 
 		 261 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  24.08 
 
 		 1067 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  20.62 
 
 		 1111 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  22.61 
 
 		 446 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  25.48 
 
 		 963 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  20.82 
 
 		 572 aa  45.8  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  24.9 
 
 		 1119 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  27.97 
 
 		 943 aa  45.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  24.67 
 
 		 993 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 489 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  22.44 
 
 		 985 aa  44.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  23.92 
 
 		 931 aa  44.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>